Introducción El pesquisaje de anomalías congénitas empleando alfa fetoproteína (AFP) del suero materno se inicia en 1982. Las gestantes con valores alterados son seguidas en consultas de genética. Objetivos: Determinar las principales causas maternas y fetales de AFP alterada, los factores de riesgo asociados y la relación con marcadores ecográficos. Metodología: Se realizó seguimiento prospectivo a 2657 gestantes a las que se les realizó AFP durante 2012 en el municipio Santa Clara. Se controlaron variables maternas: edad de la embarazada, peso, enfermedades agudas y crónicas, resultados de la AFP (se consideraron Valores elevados: 2.0+192 mmol/l, Valores bajos: 0.0-0.4 mmol/l), resultados del Ultrasonido del segundo trimestre (marcadores ecográficos, defectos congénitos estructurales, gemelaridad, existencia de aborto espontáneo u óbito fetal).  Las variables fetales controladas fueron: Defectos estructurales congénitos diagnosticados pre o postnatalmente. Resultados De las 2484 embarazadas estudiadas, el 6,8% presentaron AFP elevada y un 7,04% baja. Entre las gestantes con AFP elevada se encontraron bajo peso materno (34,3%), adolescencia, pérdidas fetales, amenaza de aborto y gemelaridad y en las AFP bajas, predominaron el bajo peso materno (16,5%), adolescencia, amenaza de aborto y edad materna avanzada. El marcador sonográfico más frecuentemente asociado a las AFP elevadas fue la visualización de atrios cerebrales aumentados y en las bajas las pielectasias, en ambos grupos en segundo lugar se asoció el polihidramnios, el 0,57% de las AFP alteradas estuvieron relacionadas con defectos congénitos mayores, Conclusiones: La alfa fetoproteína sérica materna confirmó la condición de indicador de bienestar materno-fetal.