Introducción: Las malformaciones congénitas  han cobrado cada ves más importancia,  resulta evidente su influencia en la salud de las poblaciones, por lo que debe señalarse que su importancia relativa se irá acentuando cada ves más en la medida en el que el desarrollo socio económico y sanitario favorezca la disminución de las enfermedades infecciosas y nutricionales. Objetivos: Describir los resultados del diagnóstico prenatal de malformaciones congénitas  por cuantificación de Alfafetoproteínas y ultrasonido en el municipio de Puerto Padre  Enero- Diciembre del  2013.  Métodos: Se realizó un estudio descriptivo, retrospectivo a un total de 815 gestantes se tuvo en cuenta la alfa-fetoproteínas en suero materno. Además se analiza el pesquisaje de malformaciones congénitas a través del ultrasonido del primer trimestre   utilizando como marcador sonográfico de cromosomopatías  y el USG del segundo trimestre realizado entre las semanas 18 y 22 de la gestación. Resultados: La  cobertura del programa de alfa feto proteínas se comportó en un 98.9%, el índice de positividad estuvo en un 5.1 %, la causa más frecuente de alfa feto Proteínas elevado fue la inexplicable, las malformaciones más frecuente diagnosticadas por ultrasonido fueron del sistema renal y neurológico. Se observó una tendencia descendente de las muertes neonatales de causa Genética con un ascenso de las fetales a expensa de las interrupciones voluntarias por diagnóstico prenatal por ultrasonido positivo. Conclusiones: Existió buena cobertura del programa de diagnóstico prenatal de malformaciones congénitas por cuantificación de alfabeto-proteínas y ultrasonido resaltando mayor índice de positividad que el año anterior.