Introdución: La presencia del alelo HLA-B27 está fuertemente asociado con entidades del grupo de las espondiloartropatías, enfermedades reumatológicas crónicas e inflamatorias que comparten manifestaciones clínicas y radiológicas; por esta razón, la detección de este alelo se incluye entre las pruebas que se realizan para el diagnóstico de las mismas.  Objetivos: Exponer los resultados de la estandarización de un método directo basado en técnicas moleculares para la detección del alelo HLA-B27 y la aplicación del mismo en el laboratorio de Biología Molecular del Centro Nacional de Genética Médica. Métodos: En el periodo 2010-2013 se estudiaron con esta técnica 550 muestras de ADN de pacientes con sospecha clínica de espondiloartropatías, provenientes de los servicios de reumatología del país. Resultados: El mayor porcentaje correspondió a los casos remitidos con impresión diagnóstica de artritis reactiva (50 %), espondilitis anquilosante (36 %) y uveitis anterior (22,37 %). Conclusiones: Se dispone de un PCR alelo específico para la identificación molecular del alelo HLA-B27 como apoyo al diagnóstico de las espondiloartropatías en estadios temprano y de utilidad para realizar estudios de predisposición genética en individuos sanos provenientes de familias con agregación familiar en el país.