Introducción: La Diabetes Tipo 2 (DT2) es una de las enfermedades más prevalentes entre las poblaciones latinas. A la fecha, se ha reportado un conjunto de más de 70 loci de riesgo a la DT2, pero que explican sólo una modesta fracción de la heredabilidad estimada.

Objetivos: Investigar la existencia de variantes genéticas de baja frecuencia en regiones codificantes que pudieran tener efectos mayores de riesgo en población latina.

Material y Métodos: Se realizó la secuenciación del exoma completo, a partir de muestras de DNA de 3756 individuos casos y controles de DT2 mexicanos y latinos residentes de EUA con alta proporción de ancestría nativa americana.

Resultados: Encontramos que una variante missense de baja frecuencia (c.1522G>A [p.E508K]) ubicada en el gen HNF1A, se asoció con la DT2 (OR=5.48 [IC 95%, 2.83-10.61], P=4.4x10^-7). La asociación fue replicada en dos cohortes independientes de individuos mexicanos y latinos. Los ensayos experimentales revelaron que la proteína con la variante p.E580K presenta una reducción en la actividad de transactivación de sus promotores blanco. Los pacientes diabéticos portadores de la variante no mostraron diferencias significativas en sus características clínicas, en comparación con el resto de pacientes diabéticos no portadores, sugiriendo que no se trata de una forma de diabetes de inicio temprano tipo MODY.

Conclusiones: se identificó una variante en el gen HNF1A, aparentemente exclusiva de individuos con ancestría Amerindia, asociada con el desarrollo de DT2 en poblaciones Latinas. Dicha variante podría afectar la función de la proteína, por lo que la detección de portadores tendría implicaciones terapéuticas para pacientes Latinos.