Introducción: El síndrome de Smith-Lemli-Opitz (SLO) es un error congénito del metabolismo del colesterol causante de retraso mental y malformaciones congénitas, entre ellas la holoprosencefalia (HPE) que ocurre en alrededor del 5% de los pacientes. Objetivos: Describir un hallazgo poco común en el SLO presente en un paciente con fenotipo ligero. Material y método: Se realizó el examen físico del paciente para la descripción fenotípica y la revisión bibliográfica en busca de otros reportes similares y probable explicación del hallazgo clínico en este caso. Resultados: Se presenta una paciente con fenotipo ligero de SLO, con incisivo central único, una microforma de HPE. Sus cifras de colesterol son relativamente altas y tiene dos mutaciones trasmembranales (TM), T93M y D234Y, en el gen DHCR7, comúnmente asociadas a fenotipos ligeros y moderados. Existe un solo caso reportado con SLO e incisivo central único, también con mutaciones TM y fenotipo moderado. Los restantes tienen formas clásicas de HPE y fenotipo severo de SLO y son homocigotos o heterocigotos compuestos para mutaciones que anulan la actividad enzimática. En otras formas de HPE, como la familial no sindrómica autosómica dominante, de penetrancia incompleta, la aparición del defecto requiere de la existencia de mutaciones de más de un gen relacionado con HPE. Conclusiones: Este caso aporta evidencias de que el déficit de colesterol no es por sí mismo suficiente en la aparición de la HPE en el SLO, probablemente se requiera de mutaciones en otros genes involucrados en la embriogénesis y/o de la influencia de factores ambientales.