Introducción: El Smith-Leml-Opitz (SLO) es un error congénito del metabolismo del colesterol, autosómico recesivo, con amplio espectro fenotípico y variabilidad en la expresión, que puede dificultar su sospecha clínica. El diagnóstico de laboratorio se basa en la demostración del incremento del 7-dehidrocolesterol y/o la presencia de dos mutaciones patogénicas en el gen DHCR7. Objetivo: Proponer un algoritmo para el diagnóstico del SLO en Cuba. Material y métodos: Se hizo una revisión en la literatura de las características fenotípicas más frecuentes del SLO a partir de lo cual se propusieron criterios de sospecha clínica. Se evaluaron las posibilidades tecnológicas en el país para la confirmación del diagnóstico. Resultados: Se plantean como criterios de sospecha clínica, en primer lugar la sindactilia 2-3 de los pies en presencia de al menos dos de los siguientes signos: hipotonía   y  trastornos de la  alimentación en recién nacidos y lactantes,  retraso mental o psicomotor, microcefalia,  anomalías genitales en varones,   dismorfia facial,  malformaciones internas, peso y talla inferior al 10mo percentil y trastornos conductuales. A los pacientes con sospecha clínica se les realiza determinación de esteroles por cromatografía de capa fina, si se demuestra el incremento de 7-dehidrocolesterol se confirma el diagnóstico y se procede a la determinación de las mutaciones T93M, IVS8-1G>C, F302L, D234Y. El diagnóstico prenatal solo se realiza en parejas de riesgo si en el hijo enfermo ambas mutaciones fueron identificadas. Conclusiones: Este algoritmo permite mejorar la sospecha clínica del SLO y su confirmación diagnóstica, esenciales para el asesoramiento genético, incluido el tratamiento dietético.